Cellectis genome surgery, filiale à 100% de Cellectis SA créée en 2008 est entièrement dédiée au développement d'approches thérapeutiques innovantes utilisant les méganucléases pour traiter des maladies génétiques et des infections virales persistantes.
Cellectis bioresearch filiale à 100% de Cellectis SA créée en 2008 a pour vocation le développement et la commercialisation de kits de recherche proposant des solutions « clé en main » d’ingénierie rationnelle des génomes à l’ensemble de la communauté scientifique mondiale, tant publique que privée. Le premier produit est actuellement en phase avancée de validation et la nouvelle entité dispose d’un portefeuille de développement fort de plus de 10 produits.

Ectycell a été inaugurée en septembre 2009, elle est dédiée à la recherche et à la commercialisation, à usage industriel, des cellules souches. Elle se consacre pour l’instant au développement :
Les cellules souches sont capables de se diviser ou de se renouveler à l’identique indéfiniment, ainsi que de se différencier en une multitude de types cellulaires. A ce titre, elles pourraient révolutionner la recherche et les soins médicaux.
Les technologies clés de Cellectis peuvent jouer un rôle majeur dans ce domaine. Ectycell s’attaque notamment à la réduction du taux élevé d’attrition dans le développement des médicaments par la mise au point de tests précoces qui permettent de mieux envisager l’effet d’une molécule sur l’organisme dans son ensemble ou sur une population génétiquement variée. Ectycell pourrait également ouvrir de nouvelles voies dans le domaine de la médecine régénérative, plus particulièrement pour des pathologies de type Alzheimer ou Parkinson.

Créée en mars 2010, Cellectis plant sciences est une filiale dédiée aux applications des méganucléases dans les plantes. Cette filiale a pour principales missions de généraliser et accélérer l’exploitation de la technologie Cellectis en agrobiologie, d’élargir les compétences de la société afin de provoquer de nouvelles opportunités, d’octroyer des licences plus étendues et d’amorcer le développement de traits propriétaires pour des applications choisies.
Cellectis plant sciences est implantée à Minneapolis (Minnesota), aux Etats-Unis, dans des laboratoires à proximité de l’Université du Minnesota et de ses serres. Son Directeur scientifique, le Professeur Daniel Voytas, également Directeur du Centre d’ingénierie des génomes de l’Université du Minnesota, est un scientifique de renommée internationale et un expert reconnu en ingénierie des génomes de plantes. Le Docteur Feng Zhang, collaborateur clé du laboratoire Voytas depuis 2008, a rejoint la société pour exercer la fonction de Directeur de recherche.